Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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