Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS72Q15906 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VPS72Q15906 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms