Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
HERC1Q15751 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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HERC1Q15751 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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HERC1Q15751 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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HERC1Q15751 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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HERC1Q15751 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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HERC1Q15751 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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HERC1Q15751 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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