Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF13Q15543 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF13Q15543 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF13Q15543 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF13Q15543 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF13Q15543 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF13Q15543 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF13Q15543 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF13Q15543 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF13Q15543 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF13Q15543 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF13Q15543 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF13Q15543 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF13Q15543 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms