Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDK3Q15120 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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