Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PDK1Q15118 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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PDK1Q15118 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PDK1Q15118 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK1Q15118 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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PDK1Q15118 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PDK1Q15118 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PDK1Q15118 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PDK1Q15118 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PDK1Q15118 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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