Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCD1Q15116 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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