Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCLAFQ15004 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCLAFQ15004 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCLAFQ15004 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms