Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IHHQ14623 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IHHQ14623 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IHHQ14623 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IHHQ14623 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IHHQ14623 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IHHQ14623 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IHHQ14623 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IHHQ14623 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IHHQ14623 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IHHQ14623 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IHHQ14623 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IHHQ14623 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IHHQ14623 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IHHQ14623 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IHHQ14623 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
IHHQ14623 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IHHQ14623 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IHHQ14623 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IHHQ14623 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IHHQ14623 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IHHQ14623 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IHHQ14623 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IHHQ14623 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IHHQ14623 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IHHQ14623 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IHHQ14623 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IHHQ14623 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IHHQ14623 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IHHQ14623 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IHHQ14623 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IHHQ14623 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IHHQ14623 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IHHQ14623 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IHHQ14623 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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