Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HNF4GQ14541 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HNF4GQ14541 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms