Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCINQ13939 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCINQ13939 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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