Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms