Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDX39BQ13838 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms