Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MTMR3Q13615 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms