Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRJQ12913 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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PTPRJQ12913 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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PTPRJQ12913 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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PTPRJQ12913 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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PTPRJQ12913 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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PTPRJQ12913 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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PTPRJQ12913 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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PTPRJQ12913 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRJQ12913 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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