Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms