Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC36■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HMGXB3Q12766 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HMGXB3Q12766 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
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