Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 YOR376WYOR376W 369 nt1.17□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 REV3YPL167C 4515 nt1.17□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 NST1YNL091W 3723 nt1.16□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 YDR029WYDR029W 315 nt1.16□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 BER1YLR412W 825 nt1.16□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 UFD2YDL190C 2886 nt1.16□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 RAD9YDR217C 3930 nt1.15□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 RAD50YNL250W 3939 nt1.15□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 MUK1YPL070W 1839 nt1.15□□□□□ -2.22
SNF8Q12483 OCA6YDR067C 675 nt1.15□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.15□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.15□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 FCF2YLR051C 654 nt1.15□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 SHE9YDR393W 1371 nt1.15□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 SNU56YDR240C 1479 nt1.15□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.15□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 SRP14YDL092W 441 nt1.14□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YDL152WYDL152W 366 nt1.14□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 RPS18BYML026C 441 nt1.14□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 CTK3YML112W 891 nt1.14□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YPR099CYPR099C 357 nt1.14□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 CLU1YMR012W 3834 nt1.14□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 RPL40BYKR094C 387 nt1.13□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YNL114CYNL114C 372 nt1.13□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 SVS1YPL163C 783 nt1.13□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 HDA3YPR179C 1968 nt1.13□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 DCP2YNL118C 2913 nt1.13□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 SWI5YDR146C 2130 nt1.13□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 NUP188YML103C 4968 nt1.13□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 ZRG17YNR039C 1818 nt1.12□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 PAN3YKL025C 2040 nt1.12□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YGL217CYGL217C 342 nt1.12□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.12□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 ANS1YHR126C 480 nt1.12□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 TIM18YOR297C 579 nt1.12□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YPR039WYPR039W 336 nt1.12□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 SEC3YER008C 4011 nt1.12□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YCS4YLR272C 3531 nt1.12□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 TRM732YMR259C 4263 nt1.12□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 MDS3YGL197W 4464 nt1.11□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 PAU2YEL049W 363 nt1.11□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YGR283CYGR283C 1026 nt1.11□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YOL159CYOL159C 516 nt1.11□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.11□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YPR063CYPR063C 423 nt1.11□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 SLX4YLR135W 2247 nt1.1□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YDL211CYDL211C 1119 nt1.1□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 ILM1YJR118C 612 nt1.1□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YBR032WYBR032W 303 nt1.1□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YSY6YBR162W-A 198 nt1.1□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YLL054CYLL054C 2532 nt1.1□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YLR422WYLR422W 5799 nt1.09□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.09□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YDR509WYDR509W 348 nt1.09□□□□□ -2.23
SNF8Q12483 YJR029WYJR029W 5268 nt1.08□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.08□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 MSH3YCR092C 3057 nt1.08□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 snR84snR84 550 nt1.08□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.08□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.08□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 GAL7YBR018C 1101 nt1.08□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 YOP1YPR028W 543 nt1.08□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 SPR3YGR059W 1539 nt1.08□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 LAA1YJL207C 6045 nt1.08□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 GDS1YOR355W 1569 nt1.08□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 ZIP1YDR285W 2628 nt1.07□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 SGO1YOR073W 1773 nt1.07□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 MET32YDR253C 576 nt1.07□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 RCN2YOR220W 798 nt1.07□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 YOR248WYOR248W 303 nt1.07□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 snR14snR14 160 nt1.07□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 YBR071WYBR071W 636 nt1.07□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 APL1YJR005W 2103 nt1.06□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 VAM6YDL077C 3150 nt1.06□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 VPS54YDR027C 2670 nt1.05□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 YLL020CYLL020C 306 nt1.05□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.05□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 RPL9BYNL067W 576 nt1.05□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 TTI1YKL033W 3117 nt1.05□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 TOF2YKR010C 2316 nt1.05□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 HUR1YGL168W 333 nt1.04□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 APQ13YJL075C 417 nt1.04□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 SWI4YER111C 3282 nt1.04□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 SIP4YJL089W 2490 nt1.04□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 ROM2YLR371W 4071 nt1.03□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 MKT1YNL085W 2493 nt1.03□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 YDR008CYDR008C 351 nt1.03□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 YER135CYER135C 393 nt1.03□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 YGR025WYGR025W 303 nt1.03□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 YAP3YHL009C 993 nt1.03□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 TMA22YJR014W 597 nt1.03□□□□□ -2.24
SNF8Q12483 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 RPL34BYIL052C 366 nt1.02□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 GPI15YNL038W 690 nt1.02□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.01□□□□□ -2.25
SNF8Q12483 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.01□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.9 ms