Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 VMR1YHL035C 4779 nt2.25□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 FAR11YNL127W 2862 nt2.25□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 CDC27YBL084C 2277 nt2.25□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 PEP3YLR148W 2757 nt2.25□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 SEF1YBL066C 3447 nt2.24□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 ORC2YBR060C 1863 nt2.24□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 OSH6YKR003W 1347 nt2.24□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 KRE33YNL132W 3171 nt2.24□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.24□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 RPS29AYLR388W 171 nt2.24□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 YCL023CYCL023C 348 nt2.24□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 snR51snR51 107 nt2.24□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 SPO22YIL073C 2928 nt2.24□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 SWA2YDR320C 2007 nt2.24□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 PEX8YGR077C 1770 nt2.23□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 YLR149CYLR149C 2193 nt2.23□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 RPA34YJL148W 702 nt2.23□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 TRA1YHR099W 11235 nt2.23□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 MNL2YLR057W 2550 nt2.23□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.22□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 DAD3YBR233W-A 285 nt2.22□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 SIR4YDR227W 4077 nt2.22□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 DNF1YER166W 4716 nt2.21□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 SCH9YHR205W 2475 nt2.21□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 YJL015CYJL015C 285 nt2.21□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 STB4YMR019W 2850 nt2.21□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 HDA3YPR179C 1968 nt2.21□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 VPH1YOR270C 2523 nt2.21□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 CSF1YLR087C 8877 nt2.2□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 PEX4YGR133W 552 nt2.2□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 DBP6YNR038W 1890 nt2.2□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 UBR1YGR184C 5853 nt2.2□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 YOL098CYOL098C 3114 nt2.2□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 CDC53YDL132W 2448 nt2.19□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 VPS34YLR240W 2628 nt2.19□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 HTL1YCR020W-B 237 nt2.19□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 RPL42BYHR141C 321 nt2.19□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 RPL42AYNL162W 321 nt2.19□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 YBL083CYBL083C 426 nt2.19□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 HHT1YBR010W 411 nt2.19□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.19□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 YOP1YPR028W 543 nt2.19□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 RIM20YOR275C 1986 nt2.19□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 GRR1YJR090C 3456 nt2.18□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 EMP24YGL200C 612 nt2.18□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 SEC31YDL195W 3822 nt2.18□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 MGM1YOR211C 2646 nt2.18□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 SET2YJL168C 2202 nt2.17□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 EFR3YMR212C 2349 nt2.17□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 YDR344CYDR344C 444 nt2.17□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 YGR069WYGR069W 336 nt2.17□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 YIL102CYIL102C 306 nt2.17□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.17□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 MCM22YJR135C 720 nt2.17□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 YLR053CYLR053C 327 nt2.17□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.17□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 PHO2YDL106C 1680 nt2.16□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 PEP1YBL017C 4740 nt2.16□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 UPS1YLR193C 528 nt2.16□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 COS111YBR203W 2775 nt2.16□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 SLM1YIL105C 2061 nt2.16□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 EDS1YBR033W 2760 nt2.15□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 SSD1YDR293C 3753 nt2.15□□□□□ -2.06
LCB4Q12246 NOP53YPL146C 1368 nt2.15□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.15□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 RPL38YLR325C 237 nt2.15□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.15□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YNL114CYNL114C 372 nt2.15□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YOR333CYOR333C 417 nt2.15□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 NUT2YPR168W 474 nt2.15□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 RAV1YJR033C 4074 nt2.15□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 PSD2YGR170W 3417 nt2.14□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 IRC8YJL051W 2469 nt2.14□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 NUP100YKL068W 2880 nt2.14□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 NPC2YDL046W 522 nt2.14□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YDR426CYDR426C 378 nt2.14□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 CYC7YEL039C 342 nt2.14□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YIL032CYIL032C 357 nt2.14□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 PCC1YKR095W-A 267 nt2.14□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 BNI1YNL271C 5862 nt2.14□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 GYP5YPL249C 2685 nt2.14□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YDL211CYDL211C 1119 nt2.13□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 PAU8YAL068C 363 nt2.13□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 PAU20YOL161C 363 nt2.13□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 PXA2YKL188C 2562 nt2.13□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 SAP185YJL098W 3177 nt2.12□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 GIP3YPL137C 3831 nt2.12□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 MRP10YDL045W-A 288 nt2.12□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YDL062WYDL062W 426 nt2.12□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YRB1YDR002W 606 nt2.12□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YDR286CYDR286C 345 nt2.12□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 TOF1YNL273W 3717 nt2.11□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 ZRG8YER033C 3231 nt2.11□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 HOP2YGL033W 657 nt2.11□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.11□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YGR265WYGR265W 411 nt2.11□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 RPS17AYML024W 411 nt2.11□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.11□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 SWI6YLR182W 2412 nt2.11□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 SWI5YDR146C 2130 nt2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.9 ms