Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 LEE1YPL054W 906 nt1.73□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 HIR3YJR140C 4947 nt1.73□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 AGC1YPR021C 2709 nt1.73□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YJR039WYJR039W 3366 nt1.73□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 HSH155YMR288W 2916 nt1.73□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 BPH1YCR032W 6504 nt1.72□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 MSC6YOR354C 2079 nt1.72□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YDL011CYDL011C 324 nt1.72□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YDR008CYDR008C 351 nt1.72□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YDR269CYDR269C 324 nt1.72□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.72□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 TMA10YLR327C 261 nt1.72□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 TDA9YML081W 3756 nt1.72□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 IRE1YHR079C 3348 nt1.72□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 VPS15YBR097W 4365 nt1.72□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 CTR9YOL145C 3234 nt1.72□□□□□ -2.13
VAM3Q12241 SSQ1YLR369W 1974 nt1.71□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YHR210CYHR210C 1026 nt1.71□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 RPL32YBL092W 393 nt1.71□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YBR285WYBR285W 435 nt1.71□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YNL144CYNL144C 2223 nt1.7□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 WIP1YDR374W-A 270 nt1.7□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YHR138CYHR138C 345 nt1.7□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 ABM1YJR108W 372 nt1.7□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 MCM22YJR135C 720 nt1.7□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 PAU18YLL064C 363 nt1.7□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 PAU6YNR076W 363 nt1.7□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YBL108WYBL108W 306 nt1.7□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YOR053WYOR053W 342 nt1.7□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 SEC31YDL195W 3822 nt1.7□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 PEX8YGR077C 1770 nt1.7□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 SPO23YBR250W 1572 nt1.69□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 HDA3YPR179C 1968 nt1.69□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 VPS34YLR240W 2628 nt1.69□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 PAU3YCR104W 375 nt1.69□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YDR157WYDR157W 402 nt1.69□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.69□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 TIM13YGR181W 318 nt1.69□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YLR434CYLR434C 384 nt1.69□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 SWI5YDR146C 2130 nt1.69□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YGR265WYGR265W 411 nt1.68□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 RPS27AYKL156W 249 nt1.68□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YAR047CYAR047C 321 nt1.68□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 RPL9BYNL067W 576 nt1.68□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YCL046WYCL046W 324 nt1.68□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 MSH6YDR097C 3729 nt1.68□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 RLM1YPL089C 2031 nt1.67□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 GUP1YGL084C 1683 nt1.67□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 OSH6YKR003W 1347 nt1.67□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 EMP24YGL200C 612 nt1.67□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 PHS1YJL097W 654 nt1.67□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.67□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 NOP53YPL146C 1368 nt1.67□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 FAB1YFR019W 6837 nt1.66□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 ZRG17YNR039C 1818 nt1.66□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 MAK10YEL053C 2202 nt1.66□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 BSC3YLR465C 309 nt1.66□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 GYP5YPL249C 2685 nt1.66□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 TBS1YBR150C 3285 nt1.66□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.66□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 FIG2YCR089W 4830 nt1.65□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 FRK1YPL141C 2598 nt1.65□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 MDM20YOL076W 2391 nt1.65□□□□□ -2.14
VAM3Q12241 MSH5YDL154W 2706 nt1.65□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.65□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 HHT1YBR010W 411 nt1.65□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.65□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 PEP1YBL017C 4740 nt1.65□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.64□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 AIM9YER080W 1884 nt1.64□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 HMI1YOL095C 2121 nt1.64□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 PKH3YDR466W 2697 nt1.63□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 PXA2YKL188C 2562 nt1.63□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 DCP2YNL118C 2913 nt1.63□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 PRE4YFR050C 801 nt1.63□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 SAR1YPL218W 573 nt1.63□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 REV3YPL167C 4515 nt1.63□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.62□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 YAP6YDR259C 1152 nt1.62□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 YML003WYML003W 873 nt1.62□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 HCH1YNL281W 462 nt1.62□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 YPL229WYPL229W 621 nt1.62□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 SWI6YLR182W 2412 nt1.62□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 PCF11YDR228C 1881 nt1.62□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.61□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 DAD4YDR320C-A 219 nt1.61□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 TRX1YLR043C 312 nt1.61□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 RPL26AYLR344W 384 nt1.61□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 RTP1YMR185W 2946 nt1.6□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 RPL31AYDL075W 342 nt1.6□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 YEL057CYEL057C 702 nt1.6□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 RTR1YER139C 681 nt1.6□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 YKL083WYKL083W 615 nt1.6□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 ISF1YMR081C 1017 nt1.6□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 YOP1YPR028W 543 nt1.6□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 UTP21YLR409C 2820 nt1.6□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 LYS14YDR034C 2373 nt1.59□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 ZIP1YDR285W 2628 nt1.59□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 YIL059CYIL059C 366 nt1.59□□□□□ -2.15
VAM3Q12241 SKI3YPR189W 4299 nt1.59□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.8 ms