Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 CDC36YDL165W 576 nt2.21□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 YDL211CYDL211C 1119 nt2.21□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 AFI1YOR129C 2682 nt2.21□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 VPS13YLL040C 9435 nt2.21□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 YLL032CYLL032C 2478 nt2.2□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 RAV1YJR033C 4074 nt2.2□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 UBR1YGR184C 5853 nt2.2□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 YGL069CYGL069C 465 nt2.2□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 YIL102CYIL102C 306 nt2.2□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 MCD1YDL003W 1701 nt2.2□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 RBK1YCR036W 1002 nt2.19□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt2.19□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 YIL032CYIL032C 357 nt2.19□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 SDH2YLL041C 801 nt2.19□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 ABF2YMR072W 552 nt2.19□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 snR49snR49 165 nt2.19□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 RRP6YOR001W 2202 nt2.19□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 BFA1YJR053W 1725 nt2.19□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 NCL1YBL024W 2055 nt2.18□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 FMP16YDR070C 282 nt2.18□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 DOT6YER088C 2013 nt2.18□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 SMC6YLR383W 3345 nt2.18□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 HCS1YKL017C 2052 nt2.18□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 ARP7YPR034W 1434 nt2.17□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 SAP185YJL098W 3177 nt2.17□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 VPS35YJL154C 2835 nt2.17□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 SAP190YKR028W 3102 nt2.17□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 YLR294CYLR294C 330 nt2.17□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 DAD3YBR233W-A 285 nt2.17□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 YCK3YER123W 1575 nt2.17□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 UBP11YKR098C 2154 nt2.17□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.16□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 RPS27AYKL156W 249 nt2.16□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.16□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 YBR064WYBR064W 429 nt2.16□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 PTC5YOR090C 1719 nt2.16□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 IRC8YJL051W 2469 nt2.15□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 PAN3YKL025C 2040 nt2.15□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 SGD1YLR336C 2700 nt2.15□□□□□ -2.06
UBX3Q12229 SMD1YGR074W 441 nt2.15□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 NOP10YHR072W-A 177 nt2.15□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.15□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 GIP3YPL137C 3831 nt2.15□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 VTC1YER072W 390 nt2.14□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.14□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 GUP1YGL084C 1683 nt2.14□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 NPR2YEL062W 1848 nt2.14□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 UTP22YGR090W 3714 nt2.14□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 IST2YBR086C 2841 nt2.13□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YIL059CYIL059C 366 nt2.13□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 RPA34YJL148W 702 nt2.13□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.13□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.13□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.13□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 IES4YOR189W 351 nt2.13□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 SNC2YOR327C 348 nt2.13□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 ALK2YBL009W 2031 nt2.13□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 SOK2YMR016C 2358 nt2.13□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 HDA3YPR179C 1968 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 COG8YML071C 1824 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 MGM1YOR211C 2646 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 snR60snR60 104 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 PRE4YFR050C 801 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YHL042WYHL042W 453 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 PAM16YJL104W 450 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 UPS1YLR193C 528 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 HHT1YBR010W 411 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 VPH1YOR270C 2523 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 MDM20YOL076W 2391 nt2.12□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 NAB6YML117W 3405 nt2.11□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 SSD1YDR293C 3753 nt2.11□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 TAE2YPL009C 3117 nt2.11□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 TOF1YNL273W 3717 nt2.11□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 NPC2YDL046W 522 nt2.11□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 APQ12YIL040W 417 nt2.11□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YLR053CYLR053C 327 nt2.11□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 TUS1YLR425W 3924 nt2.11□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 MET18YIL128W 3099 nt2.11□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 TOF2YKR010C 2316 nt2.11□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 RTT101YJL047C 2529 nt2.11□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YOL098CYOL098C 3114 nt2.11□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 RIM20YOR275C 1986 nt2.1□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YPR063CYPR063C 423 nt2.1□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 DFG16YOR030W 1860 nt2.09□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 BNI1YNL271C 5862 nt2.09□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 MVP1YMR004W 1536 nt2.09□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 ATP7YKL016C 525 nt2.09□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 RPL38YLR325C 237 nt2.09□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 DGR1YNL130C-A 147 nt2.09□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 NUT2YPR168W 474 nt2.09□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 YCL023CYCL023C 348 nt2.09□□□□□ -2.07
UBX3Q12229 TRL1YJL087C 2484 nt2.09□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 NOP53YPL146C 1368 nt2.09□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YBR224WYBR224W 516 nt2.08□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 UFD4YKL010C 4452 nt2.08□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 BRE1YDL074C 2103 nt2.08□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 VMR1YHL035C 4779 nt2.07□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 SPO22YIL073C 2928 nt2.07□□□□□ -2.08
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