Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms