Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN5Q08AF3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms