Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD47Q08722 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD47Q08722 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD47Q08722 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD47Q08722 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD47Q08722 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD47Q08722 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD47Q08722 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD47Q08722 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD47Q08722 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD47Q08722 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD47Q08722 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CD47Q08722 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CD47Q08722 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CD47Q08722 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CD47Q08722 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD47Q08722 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD47Q08722 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms