Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF4Q08170 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF4Q08170 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms