Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TYRO3Q06418 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TYRO3Q06418 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TYRO3Q06418 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TYRO3Q06418 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TYRO3Q06418 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TYRO3Q06418 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYRO3Q06418 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms