Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBE3AQ05086 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms