Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms