Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALDH6A1Q02252 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms