Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 RTT102YGR275W 474 nt1.72□□□□□ -2.13
SKO1Q02100 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.72□□□□□ -2.13
SKO1Q02100 FYV12YOR183W 390 nt1.72□□□□□ -2.13
SKO1Q02100 YPL182CYPL182C 384 nt1.72□□□□□ -2.13
SKO1Q02100 IRE1YHR079C 3348 nt1.71□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 VPS15YBR097W 4365 nt1.71□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 UBP2YOR124C 3819 nt1.71□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YDR008CYDR008C 351 nt1.71□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.71□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 PAU18YLL064C 363 nt1.71□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 PAU6YNR076W 363 nt1.71□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 FMP23YBR047W 528 nt1.71□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YCL046WYCL046W 324 nt1.71□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 UFD4YKL010C 4452 nt1.71□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 CTR9YOL145C 3234 nt1.71□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 TBS1YBR150C 3285 nt1.7□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 PAU3YCR104W 375 nt1.7□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 ABM1YJR108W 372 nt1.7□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YLR255CYLR255C 354 nt1.7□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YBL073WYBL073W 312 nt1.7□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 RPL32YBL092W 393 nt1.7□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 MRPL50YNR022C 420 nt1.7□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 RLM1YPL089C 2031 nt1.69□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 SEC31YDL195W 3822 nt1.69□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 HDA3YPR179C 1968 nt1.69□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 RPS24BYIL069C 408 nt1.69□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YBL012CYBL012C 402 nt1.69□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 MON2YNL297C 4911 nt1.68□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YFR016CYFR016C 3702 nt1.68□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 MDM20YOL076W 2391 nt1.68□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 SWI5YDR146C 2130 nt1.68□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.68□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 OSH6YKR003W 1347 nt1.67□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 VPS34YLR240W 2628 nt1.67□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 WIP1YDR374W-A 270 nt1.67□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YGR265WYGR265W 411 nt1.67□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.67□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 PHS1YJL097W 654 nt1.67□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YKL202WYKL202W 582 nt1.67□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.67□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YOR146WYOR146W 306 nt1.67□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 NOP53YPL146C 1368 nt1.67□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 LHS1YKL073W 2646 nt1.67□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 PKH3YDR466W 2697 nt1.66□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YDL011CYDL011C 324 nt1.66□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 RPL31AYDL075W 342 nt1.66□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YER079WYER079W 633 nt1.66□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YHR210CYHR210C 1026 nt1.66□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 YOL159CYOL159C 516 nt1.66□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 PEX8YGR077C 1770 nt1.66□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 LRE1YCL051W 1752 nt1.66□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 MSH5YDL154W 2706 nt1.66□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 ZRG17YNR039C 1818 nt1.66□□□□□ -2.14
SKO1Q02100 TRX1YLR043C 312 nt1.65□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.65□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 RRT1YBL048W 312 nt1.65□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YOR392WYOR392W 444 nt1.65□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YPL185WYPL185W 396 nt1.65□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 SWF1YDR126W 1011 nt1.64□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 TIM13YGR181W 318 nt1.64□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 MAK10YEL053C 2202 nt1.64□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 FRK1YPL141C 2598 nt1.63□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 RPS27AYKL156W 249 nt1.63□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.63□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.63□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YLR434CYLR434C 384 nt1.63□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 LEE1YPL054W 906 nt1.63□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 PXA2YKL188C 2562 nt1.63□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YLR419WYLR419W 4308 nt1.63□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YDR269CYDR269C 324 nt1.62□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.62□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YAR047CYAR047C 321 nt1.62□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.62□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 HMI1YOL095C 2121 nt1.62□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.61□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YHR138CYHR138C 345 nt1.61□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 RPL9BYNL067W 576 nt1.61□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 HCH1YNL281W 462 nt1.61□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 HHT1YBR010W 411 nt1.61□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 SAR1YPL218W 573 nt1.61□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YOP1YPR028W 543 nt1.61□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YBR285WYBR285W 435 nt1.61□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.61□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 SKI3YPR189W 4299 nt1.6□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YFL019CYFL019C 354 nt1.6□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 DCP2YNL118C 2913 nt1.6□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 FIG2YCR089W 4830 nt1.6□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 SPO23YBR250W 1572 nt1.59□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 UTP21YLR409C 2820 nt1.59□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 YOR053WYOR053W 342 nt1.59□□□□□ -2.15
SKO1Q02100 LYS14YDR034C 2373 nt1.58□□□□□ -2.16
SKO1Q02100 YAP6YDR259C 1152 nt1.58□□□□□ -2.16
SKO1Q02100 RTR1YER139C 681 nt1.58□□□□□ -2.16
SKO1Q02100 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.58□□□□□ -2.16
SKO1Q02100 KCS1YDR017C 3153 nt1.58□□□□□ -2.16
SKO1Q02100 AIM9YER080W 1884 nt1.58□□□□□ -2.16
SKO1Q02100 SWI6YLR182W 2412 nt1.58□□□□□ -2.16
SKO1Q02100 ZIP1YDR285W 2628 nt1.57□□□□□ -2.16
SKO1Q02100 SFB2YNL049C 2631 nt1.57□□□□□ -2.16
SKO1Q02100 PCF11YDR228C 1881 nt1.57□□□□□ -2.16
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