Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms