Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms