Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX1P83916 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CBX1P83916 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBX1P83916 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBX1P83916 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBX1P83916 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX1P83916 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX1P83916 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX1P83916 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX1P83916 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX1P83916 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX1P83916 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX1P83916 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX1P83916 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX1P83916 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX1P83916 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX1P83916 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CBX1P83916 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBX1P83916 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBX1P83916 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms