Protein–RNA interactions for Protein: P82912

MRPS11, 28S ribosomal protein S11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS11P82912 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPS11P82912 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms