Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMF1P82094 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMF1P82094 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMF1P82094 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMF1P82094 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMF1P82094 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMF1P82094 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMF1P82094 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMF1P82094 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMF1P82094 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMF1P82094 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMF1P82094 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TMF1P82094 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMF1P82094 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMF1P82094 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMF1P82094 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms