Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2IP78347 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms