Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM4P67936 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM4P67936 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM4P67936 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM4P67936 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM4P67936 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM4P67936 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM4P67936 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM4P67936 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM4P67936 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM4P67936 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM4P67936 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM4P67936 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM4P67936 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM4P67936 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM4P67936 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM4P67936 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM4P67936 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM4P67936 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms