Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO4P61968 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO4P61968 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO4P61968 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LMO4P61968 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LMO4P61968 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LMO4P61968 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms