Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42P60953 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42P60953 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42P60953 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42P60953 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42P60953 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42P60953 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42P60953 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42P60953 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42P60953 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42P60953 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42P60953 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42P60953 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42P60953 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42P60953 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42P60953 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42P60953 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42P60953 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42P60953 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42P60953 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42P60953 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42P60953 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42P60953 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42P60953 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42P60953 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms