Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YARSP54577 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YARSP54577 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YARSP54577 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YARSP54577 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YARSP54577 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YARSP54577 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YARSP54577 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YARSP54577 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YARSP54577 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YARSP54577 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YARSP54577 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YARSP54577 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YARSP54577 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YARSP54577 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms