Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP98P52948 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP98P52948 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP98P52948 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP98P52948 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP98P52948 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP98P52948 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP98P52948 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP98P52948 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP98P52948 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP98P52948 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP98P52948 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP98P52948 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP98P52948 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP98P52948 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP98P52948 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP98P52948 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP98P52948 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP98P52948 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP98P52948 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP98P52948 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP98P52948 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP98P52948 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP98P52948 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP98P52948 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP98P52948 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP98P52948 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP98P52948 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP98P52948 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP98P52948 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP98P52948 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP98P52948 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP98P52948 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP98P52948 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP98P52948 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms