Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SMARCA4P51532 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SMARCA4P51532 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms