Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DAP3P51398 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DAP3P51398 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DAP3P51398 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DAP3P51398 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DAP3P51398 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DAP3P51398 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DAP3P51398 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms