Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TAF6P49848 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TAF6P49848 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF6P49848 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF6P49848 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF6P49848 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF6P49848 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms