Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSEN1P49768 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms