Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP4P49662 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP4P49662 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP4P49662 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP4P49662 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP4P49662 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP4P49662 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP4P49662 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP4P49662 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP4P49662 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP4P49662 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP4P49662 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP4P49662 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP4P49662 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP4P49662 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP4P49662 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP4P49662 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP4P49662 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP4P49662 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms