Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPAP49450 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPAP49450 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPAP49450 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms