Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A3P48751 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A3P48751 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms