Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
RANGAP1P46060 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RANGAP1P46060 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms