Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECI1P42126 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECI1P42126 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECI1P42126 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ECI1P42126 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms